ברקע ריבוי הזירות והפעילות בעומק שטח לבנון, עזה, וסוריה, נערך צה״ל לקיום הבחירות תוך מציאות מבצעית מאתגרת, על מנת להבטיח כי כלל המשרתים יוכלו לממש את זכותם ולהצביע, לראשונה תוך כדי חציית גבול.
במהלך השבוע הבא ייפרסו מעל כ-850 קלפיות לכלל היחידות בכלל הגזרות המבצעיות. לפי הערכה בצה״ל מספר הקלפיות עשוי לעלות. 75% מהקלפיות נייחות ו-25% ניידות. 200 קלפיות יפתחו שבוע לפני יום הבחירות עצמו, 168 שעות לפני פתיחת הקלפיות האזרחיות.
בתיאום עם ועדת הבחירות המרכזית החל מערב ה-20 באוקטובר תחל ההצבעה המוקדמת בצה״ל, אשר תימשך לאורך 7 ימים ותגיע לשיאה ביום הבחירות הכללי ב-27 באוקטובר. את מערכת הבחירות בצה״ל תרכז אל״מ ורד בן יהודה.
במסגרת כך, מאות קלפיות נייחות וניידות יופעלו בכל מקום בו יימצאו משרתים בסדיר ובשירות מילואים פעיל. קלפי ניידת עוברת בין מספר יחידות בהתאם ללוח זמנים שנקבע מראש, ועדת הקלפי תלווה על ידי קצין או נגד חמוש אשר דואג לאבטחתה. במעבר בין יחידות, המכסה המשני של הקלפי נשאר נעול.
לחיילים קיימת האפשרות להצביע בקלפי צבאית או בקלפי אזרחית. הבחירה תהיה באמצעות מעטפות כפולות על מנת לוודא שהמצביע הוא בעל זכות הצבעה ושהוא מצביע פעם אחת. מערך הבחירות בצה"ל בתקופה זו ייקחו חלק מאות קציני בחירות וכ-3,000 חיילים שהוכשרו לשמש כחברי ועדות קלפי.
במערכת הבחירות הקודמת היו 73% הצבעה בצה״ל והערכה שבמערכת הבחירות הזו יהיו נתונים גבוהים יותר של הצבעה. בין הכוחות שיצביעו ראשונים יהיו חיילי חיל הים שיוצאים לשיט ובחו״ל. כמו כן, כל משרת בצה״ל יכול להצביע בקלפי אזרחי אם הוא ביום חופש.