צה"ל מתקרב לתרחיש של ממשל צבאי ברצועת עזה ויהיו לכך השלכות על האחריות הישראלית כלפי הפלסטינים. בעבר, שר הביטחון לשעבר יואב גלנט, והרמטכ"ל דאז הרצי הלוי, התנגדו למהלך באופן נחרץ אך אחרי אינספור סבבי לחימה ועל רקע ההגדרות הברורות של הממשלה לצה"ל לכבוש שטחים ולא לסגת מהם - נדמה שצה"ל קרוב מאוד לתרחיש הזה.
לפי מילון המונחים של צה"ל - ממשל צבאי הוא ממשל שמפעילה מדינה בשטח שכבשה - "על הממשל הצבאי למלא את צורכי האוכלוסייה החיה בשטח, ולהגן על האינטרסים הצבאיים של המדינה הכובשת בשטח הכבוש, לפי הדין הבינלאומי", נכתב.
לפי הפעולות של צה"ל בעזה היעד הקרוב ביותר לממשל צבאי יהיה רפיח, תא שטח נרחב שצה"ל מתכוון לטהר בשבועות הקרובים ממחבלים ולהניע אליו אוכלוסייה. כמו כן, על משרד מתאם פעולות הממשלה בשטחים יהיה לדאוג לאוכלוסייה שתנוע לשם למזון, למים, לרפואה, למקום לינה ולביטחון.
"הגענו למצב של אין ברירה. כשחמאס הפך לסרבן משא ומתן ולסרבן להחזיר חטופים, אין לצה"ל ברירה אלא לפעול בדרכים שהוא לא פעל בהן עד עכשיו", אמר גורם ביטחוני. לדבריו, "ברגע שאתה שולט בשטח, לאורך זמן, אתה מחויב לפי דיני המלחמה לדאוג לצורכי האוכלוסייה במספר מעגלי מחייה בסיסיים, מזון מים, רפואה ולינה. זו חובתו של הכובש במיוחד כשמדובר בכיבוש לאורך זמן".
על האפשרות שחברות אזרחיות יפקחו על חלוקת הסיוע ההומניטרי ועל הטיפול הרפואי, השיב הגורם הביטחוני כי "גם כשיופעלו חברות אזרחיות מי שינהל את האירוע יהיה צה"ל ומשרד הביטחון. זו חובה חוקית". לפי הגורם, המדיניות החדשה של צה"ל תהווה מנוף לחץ גדול מאוד על חמאס שיבין כי הוא מאבד את הרצועה ואת השליטה באוכלוסייה.
לפי בכירים במערך המילואים "הרמטכ"ל אייל זמיר מתנגד לחלוקה ישירה של מזון על ידי חיילי צה"ל. צה"ל לא יעביר ארגזי מזון לפלסטינים, אבל הרמטכ"ל בוודאי מבין שההנחיות של הדרג המדיני כוללות כיבוש ושליטה. לאורך זמן זה תהליך שכורך בתוכו ממשל צבאי".
לפי מקורות ביטחוניים נוספים, פיקוד הדרום, בפיקודו של האלוף יניב עשור, יעמוד במשימת כיבוש וטיהור מרחב רפיח תוך שבועות בודדים. בימים אלו מתמודד צה"ל עם כ-150 מחבלים במרחב, שרובם לא ממהרים להילחם ומסתתרים בתת-קרקע, במבנים שנותרו ומאחורי ההריסות.
ברגע שיסתיים שלב הכיבוש והטיהור יינתן האור הירוק בהתאם להנחיית הדרג המדיני להניע מאות אלפי פלסטינים מצפון וממרכז רצועת עזה למרחב רפיח, תחת בידוק ביטחוני. בעיר יחולקו מים, מזון, ויינתנו טיפול רפואי ומקומות לינה, והאזור יוגדר ללא לחימה. עד כה, לא ידוע על קשר עם חברה אזרחית שתיקח על עצמה את חלוקת המזון, וקיימת התנגדות של ארגוני סיוע בינלאומיים לקחת חלק ב"מודל רפיח", מה שעשוי לגלגל את האחריות חזרה לצה"ל ולמשרד הביטחון.