צה"ל עדכן הערב (שני) כי לאחר סריקות נרחבות של כוחות צה"ל במרחב יד מרדכי, נשלל החשד לאירוע בטחוני. מוקדם יותר נמסר כי נבדק דיווח על חדירת מחבל מרצועת עזה וכוחות מיוחדים הוקפצו וסרקו באזור קיבוץ יד מרדכי לשלילת האירוע. "כוחות צה"ל פרוסים במרחב ויעשו כל שידרש על מנת להגן על אזרחי מדינת ישראל", נמסר מצה"ל. בהמשך, דובר צה"ל הוסיף כי לאחר הערכת מצב, הוחלט על העלאת כוננות ועוצר יציאות לכוחות הלוחמים ולמערכים המבצעיים בגזרת פיקוד הדרום. בנוסף, הוחלט על תגבור כוחות משמעותי למשימות הגנה במרחב.
לאור החשש, חיל הים תגבר כוחות והחל לסרוק את המרחב הימי הקרוב אל החוף. חיל האוויר הפעיל כלי טיס בנגב המערבי, וכוחות אוגדה 162 תגברו את מרחב הגבול בצמוד לצפון הרצועה, כדי לשלול אפשרות שהמחבל יחזור אם הצליח לחדור לשטח ישראל. למרות האירוע, לא ניתנו הנחיות מיוחדות לתושבים בנתיב העשרה ויד מרדכי, למעט שהתבקשו להיות עירניים לצד הקפצת כיתות הכוננות באזור.
מוקדם יותר, לוחמי ימ"מ, שב"כ וצה"ל עצרו בצפון השומרון מבוקש בכיר, מראשי חמאס באזור, שתכנן לבצע פיגועים עם מחבלים נוספים, כך הותר לפרסום.
בפעילות משולבת של הכוחות בכפר סילת אל חרתיה, נעצרו מבוקשים שנמלטו מכוחות הביטחון במשך תקופה. בין העצורים, עלאא אלדין ביטאוי, תושב ג'נין, מראשי חמאס במחנה. יחד עמו נעצרו מבוקשים נוספים שהיו מעורבים בפעילות טרור. במהלך מעצרם נתפס אקדח ואותרו מטענים שהושמדו על ידי הכוחות בשטח. המבוקשים הועברו להמשך חקירה.