המבצע שהתקיים הלילה (שלישי) בבית החולים בג'נין ארך דקות ספורות. מרגע שכוחות ימ"מ פשטו על בית החולים "איבן סינא", דרך חיסול שלושת המחבלים שתכננו פיגוע, ועד ליציאת הכוחות מהמקום עברו עשר דקות בלבד. כך זה קרה:
בשעה 5:30 כוח מסוערב של ימ"מ פושט על אזור בית החולים. תוך שהם מחופשים לאנשי צוות רפואי, הלוחמים מוצאים באחת הקומות את חדר המסתור בו מסתתרים שלושת המחבלים: שני האחים מוחמד ובזיל אל-ע'זאווי, ומוחמד ג'לאמנה.
המחבלים לא מספיקים להגיב ומחוסלים במקום. על ג'לאמנה אותר אקדח שהוחרם על ידי הכוח. עד השעה 5:40 הכוח יוצא מהזירה.
הפעולה התאפשרה הודות למודיעין מדויק שהתקבל טרום הפעילות. מדובר בפעילות תקדימית שטרם נעשתה, שתוזמנה באמצעות החפ"ק האחורי של שב"כ ובשיתוף כלל הגורמים הרלוונטיים מצה"ל ומג"ב.
ישנם מבוקשים ומחבלים רבים שמסתתרים ברחבי בתי חולים ביהודה ושומרון, ובחסותם מנהלים תשתיות טרור, תוך מחשבה שלא יפגעו בהם שם. רבים מהם משתמשים בבית החולים איבן סינא בפרט. במבצעים רבים שצה"ל ערך בבית החולים הוא ספג מתוכו יריות, השלכת מטענים ויידו אבנים ובקבוקי תבערה.
גורם בכיר מסר: "אין ערי מקלט באיו"ש ולא יהיו - שידע כל מחבל את זה. ידו של צה"ל ושל מערכת הביטחון תגיע לכולם".