החשוד המרכזי בהשלכת הנפצים בכנסיית הבשורה הוא, חיים אליהו חביבי, תושב ירושלים, המוכר למשטרה על רקע ניסיונות פגיעה קודמים בכנסייות והתבטאויות שלו בנושא. בערוץ 10 דווח, כי שתי הנשים שהגיעו עימו לכנסייה הן בת זוגו וביתם המשותפת.
החשוד המרכזי בהשלכת הנפצים: חיים אליהו חביבי, תושב ירושלים