שר הביטחון, שאול מופז, שהופיע בוועדה לחקר אירועי עמונה, אמר כי "האלימות שהופגנה כלפי כוחות הביטחון היא בלתי נסבלת ובלתי מקובלת". מופז קרא לבדוק את כל הפרות החוק שהיו במקום, כי "תחילתו של האירוע הזה היא בהפרת חוק ברורה לחלוטין". לדבריו, "אי אפשר לקבל מצב של 'איש הישר בעיני יעשה'.