לאחר ביצוע תוכנית ההתנתקות, המשיכו חברי הכנסת בליכוד, שהתנגדו לתוכנית, להצביע נגד הממשלה. בין היתר, הצביעו נגד תקציב המדינה לשנת 2006 ונגד מינוי שרים חדשים.
בנובמבר 2005 נבחר עמיר פרץ ליו"ר מפלגת העבודה והודיע על פרישה מיידית של שרי המפלגה מהממשלה, דבר שהביא לפירוק הקואליציה ולהכרזה על בחירות. בסוף אותו חודש, הודיע שרון על פרישתו מהליכוד והתמודדותו לראשות הממשלה במסגרת מפלגה חדשה שהקים, מפלגת קדימה. בשלב הראשון הצטרפו לשרון 14 חברי כנסת מטעם הליכוד ולאחר מכן הצטרפו לקדימה בכירי ליכוד נוספים כמו שר הביטחון שאול מופז והשר צחי הנגבי. בבחירות פנימיות שנערכו בליכוד בדצמבר 2005 נבחר בנימין נתניהו ליו"ר הליכוד לאחר שגבר על סילבן שלום, משה פייגלין וישראל כץ.