בצה"ל מכחישים כי מפקדי הגדוד המוצב בנצרים ביקשו ממזכירות היישוב לאפשר לחיילים ללון בבית הספר במקום משום שהמבנה ממוגן מפצצות מרגמה. בקול ישראל דווח, כי קצין הבטחון של החיילים הוא שהציע להלין את החיילים בבית הספר. בצה"ל הדגישו כי מספר מבני מפקדה אכן הוצאו ממתחם נצרים, אך הצבא לא ביקש דבר מהמתנחלים.