קו הרכבת אל נתב"ג 2000 וממנו יחל לפעול ב-10 באוקטובר. בעקבות ההחלטה על הפעלת הקו בחודש הבא, תוקדם פתיחת הטרמינל לתחילת חודש נובמבר. במשך אוקטובר הקו יפעל ללא תשלום, כשהנוסעים יועברו באמצעות מעבורות מתחנת הרכבת בנתב"ג 2000, אל הטרמינל הישן.
מעבר לשיפור השירות לציבור המבקש להגיע לשדה התעופה בלי להיתקל בפקקי תנועה, חבויה בפתיחת הקו החדש, שעלותו 371 מיליון שקל, מהפכה נוספת: רכבות לילה. רכבת ישראל הודיעה כי בקו החדש לנתב"ג יפעלו 64 רכבות ביממה. לוח הזמנים מבטיח כי הרכבת הראשונה מהצפון תצא מתחנת נהריה ב-2:00 לפנות בוקר ותגיע לנתב"ג ב-3:40. הדבר יאפשר לטסים בטיסות הבוקר הראשונות להגיע בזמן לנתב"ג.
הקו החדש מנתב"ג אמור לשרת גם תושבים מיישובי האיזור. למשל תושבי מודיעין ושהם, שיוכלו להחנות בעלות של 12 שקל ליום את רכביהם במגרש החניה שצמוד לטרמינל ולנסוע ברכבת לתל אביב וליעדים אחרים.