מנהיגה הרוחני של תנועת ש"ס, הרב עובדיה יוסף, תומך בבניית גדר ההפרדה. הרב סבור כי יש לבנות את הגדר בשל פיקוח נפש. הרב עובדיה קבע כי את תוואי הגדר צריך לקבוע על פי המלצות גורמי הביטחון. בקול ישראל דווח כי עמדתו של הרב פורסמה בעקבות פגישה שקיים היום עם האלוף במיל. עוזי דיין המוביל את השדולה להקמת הגדר.