מרבית הנפגעים בפיגוע אמש בעותניאל הם חיילי צה"ל, כך הותר היום לפרסום. בגלי צה"ל דווח, כי שניים מארבעת תלמידי הישיבה שנהרגו הם חיילים, וכם גך תשעה מעשרת הפצועים. מצב אחד החיילים הפצועים הוא בינוני עד קשה ומצב היתר קל. תלמיד נוסף שהיה במקום נפצע באורח קל עד בינוני. הודעות נמסרו למשפחות ההרוגים והפצועים.
שניים מן החיילים שנפצעו באורח קל הם קצינים שהרגו את המחבל הראשון ליד הישיבה. שלושה חיילים נוספים נפצעו קל במהלך המרדף אחר המחבל השני והריגתו. אחד מארבעת התלמידים ההרוגים שהיה אחראי תורני המטבח, נעל את הדלת שמובילה לחדר האוכל, ומנע פגיעה חמורה יותר בתלמידים ובאורחיהם. המחבלים לא הצליחו לפתוח את הדלת, וירו דרכה לעבר הנוכחים בחדר האוכל.