שר התחבורה, אפרים סנה (עבודה), אמר הערב כי אין כל פסול במינויו של מאיר דגן לראשות המוסד. "העובדה שדגן עבד תקופה קצרה במשרה בכירה במשרדו של שרון, אינה פוסלת אותו מלשמש בתפקיד ממלכתי", טען סנה.
מוקדם יותר מתח מזכ"ל מפלגת העבודה, ח"כ אופיר פינס, ביקורת על כך ששרון מינה את מקורבו לתפקיד. פינס אמר כי מדובר בתקדים מסוכן ובפגיעה קשה במעמדו הציבורי של המוסד. לדבריו, דגן הוא איש ליכוד מובהק השקוע בחיים הפוליטיים, והיה פעיל במטה הבחירות של שרון.