השר להגנת הסביבה עמיר פרץ קרא לרכבת לאילת "מעשה חלם" וטען שהוא רחוק מלהיות שלם. בנאום במושב בנושא הרכבת לאילת בכנס שדרות אמר אחר הצהריים (שלישי) השר פרץ: "רק בתכנון הפרויקט הושקעו 100 מיליון שקלים וזאת כשאיש אינו יודע כיצד הרכבת תתחבר לאילת וכיצד יגיעו סחורות מהנמל לאילת. ההשפעה של נקודת הקצה על אילת כעיר תיירות היא דרמטית ועלולה להפוך אותה לעיר מטענים אבל אין עדיין אף תכנית המתייחסת לכך. בנוסף, תוואי הרכבת המתוכנן, שצפוי לעלות עשרות מיליארדים, יהרוס את הטבע האגדי בנגב ועד שלא יילקחו בחשבון פתרונות סביבתיים אמשיך להתנגד לתוכנית".