בשנת 1996 שחררה הלהקה את תקליטה "Down on the Upside". התקליט, שהציג פן קודר ומבוגר יותר של הלהקה, נכנס למצעד במקום השני.
באותה תקופה הגראנג' התחיל לצאת קצת מהאופנה, והדבר נתן את אותותיו כשהאלבום אינו מצליח כמשוער. עם זאת, לסאונדגרדן נותרו מעריצים רבים והתקליט בכל זאת סחף מכירות של אלבום פלטינה.
לאחר שעמדה בראש פסטיבל הלולאפלוזה השישי, יצאה הלהקה לסיבוב הופעות ברחבי ארה"ב.
בתשיעי לאפריל 1996 שמה הלהקה סוף לגל של שמועות והודיעה על פירוקה אחרי 12 שנים של פעילות תוך שהיא מודה למעריצים המסורים שתמכו בה לאורך השנים.