הממשלה הסורית הפכה את בתי החולים ל-"כלי דיכוי", כחלק ממאמציה למוטט את האופוזיציה, כך נכתב בדו"ח שפורסם אמש (שני) על ידי ארגון זכויות האדם "אמנסטי אינטרנשיונל". על פי הדו"ח, פצועים אשר היו מטופלים בארבעה בתי חולים ממשלתיים לפחות, היו נתונים לעינויים ולטיפול לא נאות מצד הסגל הרפואי. כמו כן, עובדים אחרים בבתי החולים, שנחשדו על ידי המשטר כי טיפלו בבני אדם שנפצעו במהלך הפגנות נגד השלטון, נעצרו ועונו גם הם.
על פי הדו"ח, עינוי המטופלים התרחש בבתי החולים הלאומיים בעיר חומס, בעיר החוף בניאס ובעיירה תל קלח. לטענת סילינה נאסר, חוקרת מטעם אמנסטי, "האפשרות שהשלטונות הסוריים נתנו לכוחות הביטחון יד חופשית בבתי החולים, וכי במקרים רבים הסגל הרפואי עינה ונתן טיפול לקוי לאנשים להם הוא אמור לדאוג היא מבהילה". רופא בעיר חומס מסר לחוקרי הארגון כי הוא בעצמו ראה למעלה מ-20 רופאים ואחים מתעללים במטופלים.
באירוע אחד שתועד בדו"ח, מפגין שהובהל בחודש אוגוסט לחדר המיון בבית החולים בתל-קלח כשהוא מחוסר הכרה, הוכה על ידי אנשי הצוות בבית החולים. אחד העדים לאירוע אמר כי "היו שבעה או שמונה אנשי ביטחון, חלק מהם חמושים ברובים, ואחיות בחלוקים לבנים שהתגודדו סביב פצוע. הוא פקח את עיניו ושאל: 'היכן אני?'. מיד קפצו עליו כולם והחלו להכות אותו".
על פי דיווחי האו"ם, מאז החלו ההפגנות נגד משטרו של אסד בסוריה נהרגו למעלה מ-3,000 אזרחים. לטענת המשטר הסורי, המפגינים משתייכים ל"קבוצות מחבלים מזויינות" שהרגו אזרחים, אנשי כוחות ביטחון ודמויות ציבוריות בולטות.