ראש הממשלה, בנימין נתניהו, הביע היום (שישי) זעזוע עמוק על רצח הרב אלעזר אבוחצירא. לדבריו, "הרב היה מנהיג רוחני של ישראלים רבים, עזר להם בעצה ובצדקה, לעיתים אף נסתרת. הרב אבוחצירא היה נצר למשפחת אבוחצירא המפורסמת שרבניה שמרו על רוחניות עם ישראל ומורשת עם ישראל". מלשכת ראש הממשלה הוסיפו כי "ראש הממשלה מתאבל עם יתר עם ישראל על האובדן הגדול".