יו"ר הרשות הפלסטינית, יאסר ערפאת, מאשים את ישראל בניסיון להרוס את קשריו עם וושינגטון, על ידי תכנון של משלוח הנשק בספינת "קארין איי". על הראיות שהציגה ישראל וקושרות את הרשות לפרשה, אמר ערפאת: "כל אלה הם אישומים חסרי בסיס שמטרתם להסיט את ארה"ב נגדנו, נגד איראן ונגד חיזבאללה".
בראיון לעיתון הלבנוני א-נהאר, שהתפרסם היום, אמר ערפאת: "הסימנים והעדויות מעלים כי היתה יד ישראלית בפרשת הספינה, שכוונה נגדנו, נגד איראן ונגד חיזבאללה". ערפאת לא הציג בראיון ראיות או הוכחות לטענתו. דבריו של יו"ר הרשות מצטרפים להכחשות שכבר פירסמו איראן וחיזבאללה, באשר למעורבותן בפרשת אוניית הנשק, עליה נתפסו כ-50 טון כלי נשק.
שלשום מסר גורם בכיר ברשות הפלסטינית כי ערפאת שיגר איגרת למזכיר המדינה האמריקאי, קולין פאוול, ובה אישר את הטענות על קשרים צבאיים בין הרשות ומשלוח הנשק. באיגרת הכחיש יו"ר הרשות כי הוא עצמו ידע על משלוח הנשק, אך הבהיר כי הוא נושא באחריות והתחייב להעניש את האחראים.