המשרד לאיכות הסביבה יקצה מיליון וחצי שקל מתקציבו לשנת 2002 לשיקום מפרץ אילת. מהמשרד נמסר כי ההחלטה התקבלה עקב ריבוי המפגעים הסביבתיים שגרמו לזיהום המפרץ. עיקר הסכום יוקצה לתוכניות מחקר וניטור (מדידת) המזהמים במפרץ ולא לשיקומו בפועל, שיצריך סכומים גבוהים בהרבה.
חלוקת המשאבים מגלה, כי חצי מיליון שקל יוקצו להכנת תוכנית ניטור כמתחייב מדו"ח המדענים הבינלאומי, שבדק את הסיבות והגורמים השונים לזיהום מימי המפרץ. סכום זהה נוסף יוקצה לעריכת תוכנית מקיפה לניטור כל המזהמים הקיימים במפרץ. בנוסף יקצה המשרד סכום המוערך בכמה מאות אלפי שקלים לתוכנית מחקר יישומי לגידול האלמוגים שמטרתה שיקום השונית.
עוד נמסר, כי המשרד פנה לאחרונה גם למשרדי התשתיות והחקלאות, החולשים על תקציב גדול בהרבה בדרישה כי גם משרדיהם יקצו משאבים למימון תוכנית הניטור הנדרשת בעקבות דו"ח המדענים.