המלצת השב"כ לאפשר תפילת יהודים על הר הבית, היא הסלמה חמורה שנועדה להתגרות בפלסטינים - כך אמר היום המופתי של ירושלים, השייח' איקרימה סברי, בראיון ל"קול פלסטין". המופתי הזהיר את ממשלת ישראל מפני התקרבות למסגד אל אקצה ואמר כי היא תישא באחריות לתוצאות צעד כזה.
ראש עיריית ירושלים, אהוד אולמרט, אמר בתגובה בראיון לקול ישראל: "אין להיכנע לאיומים ולהסתות של המוסלמים הקיצוניים". אולמרט הדגיש, כי בעיר לא היתה התקוממות אזרחית מאז תחילת האינתיפאדה. המפקד לשעבר של מחוז ירושלים במשטרה, אריה עמית, העריך, כי החזרת הסטטוס קוו לא תגרום לאלימות, וטען כי אם ישראל היא הריבון בהר, יש לאפשר ליהודים לעלות עליו.
ח"כ מוסי רז (מרצ), אמר כי "זכותם של יהודים לעלות להר, אולם העיתוי עלול לגרום לשלם מחיר דמים כבד", בדומה לתוצאות פתיחת מנהרת הכותל וביקורו של ראש הממשלה, אריאל שרון, להר הבית, כשהיה יו"ר האופוזיציה. יו"ר סיעת מרצ, ח"כ זהבה גלאון, פנתה לשרון שיקפיא את יישום ההמלצה. לדבריה, "בצעד כזה יהפוך הסכסוך לעימות דתי שיצית את כל העולם המוסלמי".