האגודה לזכויות האזרח גינתה בצהריים (שני) בחריפות את מעצרו של הרב שפירא. לדברי עורכת הדין לילה מרגלית, ראש תחום זכויות בפלילים באגודה, "טוב עשתה המשטרה משפתחה בחקירת מקרה חמור זה. הסתה לאלימות גזענית פוגעת באופן קשה בזכויות אדם ואסור לעבור עליה לסדר היום. יחד עם זאת, כלל לא ברור מה ההצדקה לביצוע מעצר במקרה כזה". עורכת הדין מרגלית הוסיפה עוד כי "המעצר אמור לשמש למקרים חריגים, בהם החשוד עשוי להוות סכנה או לשבש את החקירה; לצערנו, בישראל קיימת נטייה ל"שימוש יתר" במעצרים גם במקרים בהם אין הצדקה לכך".