מועצת חכמי התורה של ש"ס דנה הערב (חמישי) גם בפרשת עמנואל והחליטה שאנשי ש"ס ימשיכו לא להשתתף באופן אקטיבי בהפגנות ובמחאות של החרדים נגד פסיקת בג"ץ. עם זאת, הוציאה המועצה הודעה שתוקפת בחריפות את הפנייה לבג"ץ. "מועצת חכמי התורה שמעה סקירה על הנעשה וחוזרת ומתריעה כי על פי דעת תורתנו הקדושה יש לשלול כל פנייה לערכאות. כמו שפסק הרמב"ם שכל הפונה לערכאות כאילו הרים יד בתורת משה רבנו וכאילו חירף וגידף", נכתב בהודעה. אולם המועצה מתחה ביקורת גם על האפליה הנהוגה במוסדות החרדים-אשכנזיים וכתבה: "מועצת חכמי התורה מביעה בזאת את כאבה על האפליה במוסדות החינוך ובישיבות וקוראת לפתור דבר זה במסגרת הידברות".