ראש הממשלה בנימין נתניהו אמר אמש (ראשון) לאחר ההחלטה לכנס את הממשלה מחר להכרעה בנושא ועדת הבדיקה כי הוועדה תבקש לשמור על חופש הפעולה של חיילי צה"ל ותיתן מענה לדרישה הבינלאומית. ראש הממשלה אמר כי "שני עקרונות מרכזיים עמדו לנגד עיניי בהחלטה זו. קודם כל לשמור על חופש הפעולה של חיילי צה"ל ולהגן על עצמאות ואמינות מוסד התחקור הצבאי של צה"ל. דבר שני, לתת מענה אמין, שקוף ובלתי תלוי לשאלות שהעלו המדינות האחראיות בקהילה הבינלאומית לגבי האירוע הימי ומידת התאמתו לכללי המשפט הבינלאומי".