שירות הביטחון הכללי הגיב הבוקר (רביעי) לטענות הרב יצחק שפירא, לפיהן הארגון מתנכל לו. לדברי השב"כ, "הרב נעצר ונחקר בחשד שידע, לכל הפחות בדיעבד, על ביצוע הצתת המסגד ביאסוף בידי תלמידיו ובכלל זה זהותם. כלל המידע אומת במסגרת החקירה. החקירה הפלילית נמשכת וטרם מוצתה".