במערכת הביטחון הוכרזה כוננות גבוהה מחשש לפעולות טרור ומעשי טירוף מצד פלשתינים או נוצרים קיצונים ותמהונים, לקראת כניסתו של המילניום החדש.
השב"כ עבד בתיאום עם האף.בי.איי במטרה לאתר גורמים משיחיים ולמנוע כניסתם לארץ. כן הודק שיתוף הפעולה עם כוחות הביטחון הפלשתינים. החשש מטרור פלשתיני נובע גם מסיום חודש הרמדאן ו"יום ירושלים" האיראני.
אבטחה מוגברת צפויה באיזורי הבילוי וכוחות גדולים במיוחד יאבטחו מחר את תפילת הרמדאן בהר הבית. במשטרת ישראל יוקם "חדר מצב לאומי" בשיתוף גורמי תשתית והצלה. רק בגוש דן יהיו יותר מ-2,300 שוטרים. גם "מגן-דוד-אדום" יציב אמבולנסים המרכזי הערים בכוננות.