בישראל מתו עד היום 32 בני אדם משפעת החזירים. רובם היו בעלי רקע של מחלות קשות, שאובחנו גם כחולים בשפעת ומפאת חוסר הוודאות לגבי סיבת המוות נמנו כמקרי תמותה מהשפעת.
שני המקרים האחרונים של מוות מהמחלה הם של גבר בן 64 אשר היה חולה במחלות רקע קשות ומת בבית החולים רמב"ם בחיפה. המקרה השני הוא של פעוטה בת שנה אשר נולדה פגה ולדברי גורמים במשרד הבריאות סבלה מסיבוכי פגות קשים. היא הגיעה מאשפוז סיעודי לבית החולים דנה במרכז הרפואי איכילוב שם מתה.
סך הכול אובחנו בישראל 4,330 מקרים של שפעת החזירים וכיום מאושפזים 9 חולים במצב קשה במחלקות לטיפול נמרץ בבתי החולים השונים ברחבי הארץ. בתוך כך בשבוע שעבר הגיעו החיסונים הראשונים לשפעת לישראל. מתן החיסונים יחל כנראה בחודש נובמבר לאחר שהם יעברו תהליך של רישום ואישור של גורמי הרפואה. הראשונים לקבל את החיסונים יהיו צוותים רפואיים ואנשים, שנמצאים בקבוצות הסיכון ושגילם נע בין 3 ל-65.