בינואר 2006 נערכו הפריימריס, ורשימת הנבחרים לכנסת ה-17 היתה חסרה את יוסי שריד. בבחירות שנערכו במארס 2006 זכתה המפלגה ב-5 מנדטים, והיתה חברה באופוזיציה. במארס 2008 התקיימו בחירות פנימיות על ראשות המפלגה. יו"ר המפלגה ביילין הודיע שלא יתמודד וכי הוא תומך בחיים אורון, שאכן זכה לבסוף בתפקיד, לאחר שגבר על זהבה גלאון ורן כהן. ב-28 באוקטובר 2008 הודיע ביילין על פרישה מהחיים הפוליטיים, וכמה ימים אחריו, ב-1 בנובמבר, פרש גם רן כהן מהפוליטיקה.
בדצמבר 2008 נערכו פריימריז במרצ, וחבר הכנסת לשעבר אילן גילאון דורג שני, אחרי היו"ר חיים אורון. באותו חודש החליטה מרצ להתאחד עם תנועת השמאל החדשה, ואת המקום השלישי ברשימה לכנסת ה-18 תפס העיתונאי ניצן הורוביץ, כשהוא מקדים את זהבה גלאון ומוסי רז.