באפריל 2007 פורסם דו"ח הביניים של ועדת וינוגרד שגרר אחריו סדקים בקואליציה. חרף הביקורת הציבורית הקשה שהוטחה בו, אולמרט מיאן להתפטר מראשות הממשלה. בד בבד, נפתחו מספר חקירות פליליות נגדו, דבר שהחליש עוד יותר את מעמדה של המפלגה בכנסת ובציבור. ב-13 ביוני 2007 בחרה הכנסת בח"כ מטעם קדימה, שמעון פרס, לכהונת נשיא מדינת ישראל, ויומיים אחר כך הוא הושבע לתפקיד בכנסת.
אולמרט נכנע לבסוף ללחץ הציבורי, הודיע על כך שלא יתמודד בפריימריס המפלגה, וב-17 בספטמבר 2008 נבחרה שרת החוץ ציפי לבני ליו"ר המפלגה, לאחר שניצחה את יריביה למירוץ, ח"כ שאול מופז וח"כ אבי דיכטר. עם היבחרה לתפקיד, התפטר אולמרט מראשות הממשלה. לבני ניסתה להקים ממשלה בראשותה, אך כשלה בניסיונה והוכרז על הליכה לבחירות כלליות לכנסת ה-18, כשאולמרט משמש כראש ממשלת מעבר.