נשיאת בית המשפט העליון השופטת דורית ביניש מכחישה את הפרסומים, לפיהם כפה את פתיחת והפעלת המחסום שבכניסה למחנה הפליטים שועפט, בו נרצח אמש שוטר מג"ב. לאחר הפיגוע הצהירו מפכ"ל המשטרה דודי כהן ומפקד מחוז ירושלים ניצב אהרן פרנקו, כי המעבר נותר פתוח בשל קביעת בית המשפט העליון.
בהודעת הנהלת בתי המשפט נכתב, כי בג"ץ לא כפה את פתיחת והפעלת המחסום וכי מעולם לא הוציא צו ביינים ביחס לגדר הביטחון באזור זה. עוד נכתב בהודעה, כי מערכת הביטחון או המשטרה מעולם לא פנו אל בית המשפט בעניין זה.