כרטיסיה

ביוני 1991 הכריזו סלובניה וקרואטיה על עצמאותן. בתגובה ביקש המיעוט הסרבי בסלובניה סיוע ממילושביץ', שהביא לקרבות עקובי דם בין הצבא הסרבי לקרואטי. באפריל 1992 הכריזה בוסניה על עצמאותה, ושוב שלח מילושביץ' צבא להגן על המיעוט הסרבי שם. בשיא הקרבות הטילו חיילים סרבים מצור על העיר סארייבו וטבחו אלפי מוסלמים.

רק ב-1995 הסכים מילושביץ' להיכנס למשא למתן לסיום הלחימה ששיסעה את הבלקן, ובאוקטובר, בלחץ בינלאומי כבד ובתיווך האו"ם, נחתם הסכם דייטון בין מילושביץ' לנשיאי סרביה וקרואטיה. לאחר ההסכם ידע מילושביץ' מחאות רבות מבית, ובספטמבר 2000 ניצחה האופוזיציה בבחירות לנשיאות. לאחר מאבק ארוך על אשרורן מונה ויסלב קוסטוניצה לנשיא.

במאי 1999 הוכרז מילושביץ' כפושע מלחמה על ידי בית הדין הבינלאומי לפשעי מלחמה בהאג. רק ב-2001 הוסגר להאג, ומשפטו נפתח בחודש יולי אותה שנה. כמו כן חשוד מילושביץ' בהונאות בקנה מידה רחב בעת שלטונו.