האפיפיור, יוחנן פאולוס השני, גינה את מתקפת הטרור על ארה"ב ואמר כי "זהו יום שחור בהיסטוריה האנושית" וקרא לעולם "לא לתת ל"ספירלת השנאה והאלימות הזו".
האפיפיור דיבר בדרשה מיוחדת על אירועי אתמול ושאל "כיצד יכולים להתרחש אירועים של אכזריות ועצב כאלה?". האפיפיור העביר את תנחומיו לנשיא בוש והאומה האמריקאית ואמר כי לעיתים גם האמונה הדתית נראית לא מתאימה בזמני מבחן כאלה.